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PESOLE, GRAZIANO

PESOLE, GRAZIANO  

Istituto di Biomembrane, Bioenergetica e Biotecnologie Molecolari (IBIOM)  

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Titolo Data di pubblicazione Autore(i) File
A bioinformatics workflow for the analysis of transcriptome data generated by deep-sequencing 1-gen-2010 Licciulli, F; Caratozzolo, Fm; Cornacchia, S; D'Elia, D; D'Erchia, Am; Fosso, B; Grillo, G; Liuni, S; Mangiulli, M; Manzari, C; Mignone, F; Paluscio, Am; Picardi, E; Sbisà, ; Tullo, A; Pesole, G
A Differential Metabarcoding Approach to Describe Taxonomy Profiles of Bacteria and Archaea in the Saltern of Margherita di Savoia (Italy) 1-gen-2020 Leoni, Claudia; Volpicella, Mariateresa; Fosso, Bruno; Manzari, Caterina; Piancone, Elisabetta; G Dileo, Maria C; Arcadi, Erika; Yakimov, Michail; Pesole, Graziano; R Ceci, Luigi
A guideline for the annotation of UTR regulatory elements in the UTRsite collection 1-gen-2015 Giulietti, Matteo; Grillo, Giorgio; Liuni, Sabino; Pesole, Graziano
A High Performance grid-web service framework for the identification of conserved sequence tags 1-gen-2007 DOnorio De Meo, P; Carrabino, D; Sanna, N; Castrignano, T; Grillo, G; Licciulli, F; Liuni, S; Re, M; Mignone, F; Pesole, G
A new strategy to identify novel genes and gene isoforms: Analysis of human chromosomes 15, 21 and 22 1-gen-2006 Re M; Mignone F; Iacono M; Grillo G; Liuni S; Pesole G.
A Novel Computational Strategy to Identify A-to-I RNA Editing Sites by RNA-Seq Data: De Novo Detection in Human Spinal Cord Tissue 1-gen-2012 Picardi, Ernesto; Gallo, Angela; Galeano, Federica; Tomaselli, Sara; Pesole, Graziano
A NOVEL GENERAL-PURPOSE RNA-SEQ PROTOCOL OPTIMIZING THE DETECTION OF TRANSCRIPTOME EXPRESSION COMPLEXITY 1-gen-2012 Calabrese, Claudia; Mangiulli, Marina; Manzari, Caterina; Maria Paluscio, Anna; Caratozzolo, Marianofrancesco; Marzano, Flaviana; Kurelac, Ivana; Maria D'Erchia, Anna; Domenicad'Elia, ; Licciulli, Flavio; Liuni, Sabino; Picardi, Ernesto; Attimonelli, Marcella; Gasparre, Giuseppe; Maria Porcelli, Anna; Pesole, Graziano; Sbisà, Elisabetta; Tullo, Apollonia
A platform independent RNA-Seq protocol for the detection of transcriptome complexity 1-gen-2013 Calabrese, Claudia; Mangiulli, Marina; Manzari, Caterina; Maria Paluscio, Anna; Caratozzolo, MARIANO FRANCESCO; Marzano, Flaviana; Kurelac, Ivana; Maria D'Erchia, Anna; D'Elia, Domenica; Licciulli, Flavio; Liuni, Sabino; Picardi, Ernesto; Attimonelli, Marcella; Gasparre, Giuseppe; Maria Porcelli, Anna; Pesole, Graziano; Sbisà, Elisabetta; Tullo, Apollonia
A primer on machine learning techniques for genomic applications 1-gen-2021 Monaco, Alfonso; Pantaleo, Ester; Amoroso, Nicola; Lacalamita, Antonio; Lo Giudice, Claudio; Fonzino, Adriano; Fosso, Bruno; Picardi, Ernesto; Tangaro, Sabina; Pesole, Graziano; Bellotti, Roberto
A-GAME: improving the assembly of pooled functional metagenomics sequence data 1-gen-2018 Chiara, Matteo; Placido, Antonio; Picardi, Ernesto; Ceci, LUIGI RUGGIERO; Horner David, Stephen; Pesole, Graziano
Accurate detection and quantification of SARS-CoV-2 genomic and subgenomic mRNAs by ddPCR and meta-transcriptomics analysis 1-gen-2021 Oranger, Annarita; Manzari, Caterina; Chiara, Matteo; Notario, Elisabetta; Fosso, Bruno; Parisi, Antonio; Bianco, Angelica; Iacobellis, Michela; D'Avenia, Morena; D'Erchia, Anna Maria; Pesole, Graziano
Accurate quantification of bacterial abundance in metagenomic DNAs accounting for variable DNA integrity levels 1-gen-2020 Manzari, Caterina; Oranger, Annarita; Fosso, Bruno; Piancone, Elisabetta; Pesole, Graziano; D'Erchia, ANNA MARIA
Ascidian Mitogenomics: Comparison of Evolutionary Rates in Closely Related Taxa Provides Evidence of Ongoing Speciation Events 1-gen-2014 Griggio, Francesca; Voskoboynik, Ayelet; Iannelli, Fabio; Justy, Fabienne; Tilak, MarieKa; Turon, Xavier; Pesole, Graziano; Douzery, Emmanuel J. P.; Mastrototaro, Francesco; Gissi, Carmela
ASPic-GeneID: a lightweight pipeline for gene prediction and alternative isoforms detection. 1-gen-2013 Alioto, Tyler; Picardi, Ernesto; Guigó, Roderic; Pesole, Graziano
ASPIC: A web resource for alternative splicing prediction and transcript isoforms characterization 1-gen-2006 Castrignanò, Tiziana; Rizzi, Raffaella; Talamo Ivano, Giuseppe; De Meo Paolo, D Onorio; Anselmo Anna, Maria; Bonizzoni, Paola; Pesole, Graziano
ASPicDB: a database of annotated transcript and protein variants generated by alternative splicing 1-gen-2011 Pier L. Martelli; Mattia D'Antonio; Paola Bonizzoni; Tiziana Castrignano ; Anna M. D'Erchia; Paolo D'Onorio De Meo; Piero Fariselli; Michele Finelli; Flavio Licciulli; Marina Mangiulli; Flavio Mignone; Giulio Pavesi; Ernesto Picardi; Raffaella Rizzi; Ivan Rossi; Alessio Valletti; Andrea Zauli; Federico Zambelli; Rita Casadio;Graziano Pesole;
ASPicDB: a database of annotated transcript and protein variants generated by alternative splicing 1-gen-2011 Martelli, Pl; D'Antonio, M; Bonizzoni, P; Castrignanò, T; D'Erchia, Am; D'Onorio De Meo, P; Fariselli, P; Finelli, M; Licciulli, F; Mangiulli, M; Mignone, F; Pavesi, G; Picardi, E; Rizzi, R; Rossi, I; Valletti, A; Zauli, A; Zambelli, F; Casadio, R; Pesole, G
ASPicDB: A database resource for alternative splicing analysis 1-gen-2008 Castrignanò, T; D'Antonio, M; Anselmo, A; Carrabino, D; D'Onorio, Dm; D'Erchia, A; Licciulli, F; Mangiulli, M; Mignone, F; Pavesi, G; Picardi, E; Riva, A; Rizzi, R; Bonizzoni, P; Pesole, G
ASPicDB: A database web tool for alternative splicing analysis 1-gen-2015 D'Antonio, Mattia; Castrgnanò, Tiziana; Pallocca, Matteo; D'Erchia Anna, Maria; Picardi, Ernesto; Pesole, Graziano
Assembly and characterization of pandemic influenza A H1N1 genome in nasopharyngeal swabs using high-throughput pyrosequencing 1-gen-2011 Bartolini, Barbara; Chillemi, Giovanni; Abbate, Isabella; Bruselles, Alessandro; Rozera, Gabriella; Castrignanò, Tiziana; Paoletti, Daniele; Picardi, Ernesto; Desideri, Alessandro; Pesole, Graziano; Capobianchi Maria Rosaria, Osaria