Strumenti Bioinformatici per interpretare fenomeni Biologici

Biologia Computazionale Strumenti bioinformatici per interpretare fenomeni biologici Alterazioni funzionali di processi biologici come il ciclo cellulare, lo sviluppo, il differenziamento, la risposta allo stress ossidativo, l'invecchiamento e altri, sono alla base di molte malattie socialmente invalidanti. Comprendere come questi processi sono regolati è di fondamentale importanza per sviluppare protocolli clinici prognostici e diagnostici più sensibili, terapie sempre più mirate ed efficaci e per elaborare corrette politiche sociali di prevenzione. La regolazione dell'espressione genica, alla base del corretto funzionamento di ogni cellula, è un processo altamente complesso che si svolge in più tappe spazio-temporali controllate dalle interazioni multiple di diversi fattori di regolazione con uno o più geni target. La bioinformatica e la biologia computazionale, discipline che cercano di decodificare e interpretare i fenomeni biologici facendo uso delle più sofisticate tecnologie informatiche, costituiscono gli strumenti più efficaci a disposizione della moderna ricerca scientifica per studiare i meccanismi alla base di queste interazioni e capire come possibili alterazioni di questi meccanismi possono influire sulla nostra salute. Il contributo del nostro lavoro di ricerca in questo campo si prefigge di sviluppare uno strumento di analisi che, sfruttando le più moderne tecnologie informatiche di data mining, consenta la scoperta di moduli di co-regolazione genica. I criteri utilizzati per l'analisi sono la frequenza con la quale diversi motivi target di fattori di regolazione della traduzione co-occorrono in geni funzionalmente correlati nella stessa specie, e la conservazione delle caratteristiche strutturali di tali moduli in sequenze omologhe di specie diverse. UTRminer rappresenta un prototipo che è attualmente in fase di ulteriore sviluppo.