Descrizione di una procedura in silico per l'analisi di miRNA aventi come target la sequenza trailer dei geni (UnTranslated Region on 3' side - 3'UTR). Tale procedura prevede la compilazione semiautomatica, in sequenza, di tre diverse tabelle. Nella prima tabella sono raccolti i polimorfismi a singolo nucleotide (Single Nucleotide Polimorphisms - SNP) residenti nella regione 3'UTR del gene che si vuole analizzare, nella seconda tabella sono riportati i dati relativi alle sequenze del DNA recanti gli SNP e dei miRNA di cui sono target ed, in fine, nella terza tabella sono riportati i dati relativi alle energie minime di legami del duplex miRNA-RNA.
Una procedura in silico per l'analisi di miRNAs aventi come target la regione 3'UTR dei geni
Guarino Roberto;Sedile Raffaella;Sabina Saverio
2015
Abstract
Descrizione di una procedura in silico per l'analisi di miRNA aventi come target la sequenza trailer dei geni (UnTranslated Region on 3' side - 3'UTR). Tale procedura prevede la compilazione semiautomatica, in sequenza, di tre diverse tabelle. Nella prima tabella sono raccolti i polimorfismi a singolo nucleotide (Single Nucleotide Polimorphisms - SNP) residenti nella regione 3'UTR del gene che si vuole analizzare, nella seconda tabella sono riportati i dati relativi alle sequenze del DNA recanti gli SNP e dei miRNA di cui sono target ed, in fine, nella terza tabella sono riportati i dati relativi alle energie minime di legami del duplex miRNA-RNA.| File | Dimensione | Formato | |
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