Nell'ambito del progetto Bandiera Epigenomica (EPIGEN) l'attività si è focalizzata sull'applicazione del metodo INTACT (Isolation of Nuclei TAgged in specific Cell Types) allo scopo di determinare il profilo epigenomico del marcatore istonico H3K4me3 nelle cellule meiotiche di Arabidopsis. I nuclei delle cellule specifiche PMC (pollen mother cell) sono stati isolati da linee transgeniche di A. thaliana (ecotipo Col-0) recanti sia il gene della biotinilasi (BirA) con promotore costitutivo per l'actina (ACTIN2) sia il gene NTF (Nuclear Tagging Factor) sotto il controllo del promotore meiosi-specifico AtDMC1 (Disrupted Meiotic cDNA1). Sui nuclei isolati è stata effettuata la immunoprecipitazione della cromatina (ChIP) e il sequenziamento è in corso in collaborazione con l'IGA di Udine.
Applicazione del metodo INTACT per ChIP-Seq da nuclei di cellule meiotiche
Lanzillo Carmine
2016
Abstract
Nell'ambito del progetto Bandiera Epigenomica (EPIGEN) l'attività si è focalizzata sull'applicazione del metodo INTACT (Isolation of Nuclei TAgged in specific Cell Types) allo scopo di determinare il profilo epigenomico del marcatore istonico H3K4me3 nelle cellule meiotiche di Arabidopsis. I nuclei delle cellule specifiche PMC (pollen mother cell) sono stati isolati da linee transgeniche di A. thaliana (ecotipo Col-0) recanti sia il gene della biotinilasi (BirA) con promotore costitutivo per l'actina (ACTIN2) sia il gene NTF (Nuclear Tagging Factor) sotto il controllo del promotore meiosi-specifico AtDMC1 (Disrupted Meiotic cDNA1). Sui nuclei isolati è stata effettuata la immunoprecipitazione della cromatina (ChIP) e il sequenziamento è in corso in collaborazione con l'IGA di Udine.I documenti in IRIS sono protetti da copyright e tutti i diritti sono riservati, salvo diversa indicazione.
