PICARDI, ERNESTO
PICARDI, ERNESTO
Istituto di Biomembrane, Bioenergetica e Biotecnologie Molecolari (IBIOM)
Comparison of ovarian mRNA expression levels in wild and hatchery-produced greater amberjack Seriola dumerili
2024 Lavecchia, Anna; De Virgilio, Caterina; Mansi, Luigi; Manzari, Caterina; Mylonas, Constantinos C; Picardi, Ernesto; Pousis, Chrysovalentinos; Cox, Sharon N; Ventriglia, Gianluca; Zupa, Rosa; Pesole, Graziano; Corriero, Aldo
Detection of ribonucleotides embedded in DNA by Nanopore sequencing
2024 Grasso, L.; Fonzino, A.; Manzari, C.; Leonardi, T.; Picardi, E.; Gissi, C.; Lazzaro, F.; Pesole, G.; Muzi-Falconi, M.
Identification of deregulated lncRNAs in Alzheimer’s disease: an integrated gene co-expression network analysis of hippocampus and fusiform gyrus RNA-seq datasets
2024 Filomena, Ermes; Picardi, Ernesto; Tullo, Apollonia; Pesole, Graziano; D'Erchia, Anna Maria
Macroalgal microbiomes unveil a valuable genetic resource for halogen metabolism
2024 Lavecchia, Anna; Fosso, Bruno; Engelen, Aschwin H.; Borin, Sara; Manzari, Caterina; Picardi, Ernesto; Pesole, Graziano; Placido, Antonio
Mitochondrial and Nuclear DNA Variants in Amyotrophic Lateral Sclerosis: Enrichment in the Mitochondrial Control Region and Sirtuin Pathway Genes in Spinal Cord Tissue
2024 NATASHA COX, Sharon; LO GIUDICE, Claudio; Lavecchia, Anna; Luana Poeta, Maria; Chiara, Matteo; Picardi, Ernesto; Pesole, Graziano
OPA1 mutation affects autophagy and triggers senescence in autosomal dominant optic atrophy plus fibroblasts
2024 Zanfardino, P.; Amati, A.; Doccini, S.; Cox, S. N.; Tullo, A.; Longo, G.; D'Erchia, A.; Picardi, E.; Nesti, C.; Santorelli, F. M.; Petruzzella, V.
Cyclic AMP induces reversible EPAC1 condensates that regulate histone transcription
2023 Felicia Iannucci, Liliana; D'Erchia, ANNA MARIA; Picardi, Ernesto; Bettio, Daniela; Conca, Filippo; Surdo, NICOLETTA CONCETTA; DI BENEDETTO, Giulietta; Musso, Deborah; Arrigoni, Cristina; Lolicato, Marco; Vismara, Mauro; Grisan, Francesca; Salviati, Leonardo; Milanesi, Luciano; Pesole, Graziano; Lefkimmiatis, Konstantinos
Dysregulation of testis mRNA expression levels in hatchery-produced vs wild greater amberjack Seriola dumerili
2023 Lavecchia, Anna; Manzari, Caterina; Pousis, Chrysovalentinos; Mansi, Luigi; Cox, Sharon N.; Mylonas, Constantinos C.; Zupa, Rosa; Lo Giudice, Claudio; De Virgilio, Caterina; Picardi, Ernesto; Ventriglia, Gianluca; Pesole, Graziano; Corriero, Aldo
Mitofusin 2 mutation drives cell proliferation in Charcot-Marie-Tooth 2A fibroblasts
2023 Zanfardino, P.; Longo, G.; Amati, A.; Morani, F.; Picardi, E.; Girolamo, F.; Pafundi, M.; Cox, S. N.; Manzari, C.; Tullo, A.; Doccini, S.; Santorelli, F. M.; Petruzzella, V.
UTRdb 2.0: a comprehensive, expert curated catalog of eukaryotic mRNAs untranslated regions
2023 Giudice, C. L.; Zambelli, F.; Chiara, M.; Pavesi, G.; Tangaro, M. A.; Picardi, E.; Pesole, G.
"Good Wine Makes Good Blood": An Integrated Approach to Characterize Autochthonous Apulian Grapevines as Promising Candidates for Healthy Wines
2022 Sabetta, Wilma; Centrone, Mariangela; D'Agostino, Mariagrazia; Difonzo, Graziana; Mansi, Luigi; Tricarico, Giovanni; Venerito, Pasquale; Picardi, Ernesto; Ceci, LUIGI RUGGIERO; Tamma, Grazia; Caponio, Francesco; Montemurro, Cinzia; Volpicella, Mariateresa
Next generation sequencing of SARS-CoV-2 genomes: Challenges, applications and opportunities
2021 Chiara, M.; D'Erchia, A. M.; Gissi, C.; Manzari, C.; Parisi, A.; Resta, N.; Zambelli, F.; Picardi, E.; Pavesi, G.; Horner, D. S.; Pesole, G.
REDIportal: Millions of novel A-to-I RNA editing events from thousands of RNAseq experiments
2021 Mansi, L.; Tangaro, M. A.; Lo Giudice, C.; Flati, T.; Kopel, E.; Schaffer, A. A.; Castrignano, T.; Chillemi, G.; Pesole, G.; Picardi, E.
HPC-REDItools: a novel HPC-aware tool for improved large scale RNA-editing analysis
2020 Flati, Tiziano; Gioiosa, Silvia; Spallanzani, Nicola; Tagliaferri, Ilario; Diroma, Maria Angela; Pesole, Graziano; Chillemi, Giovanni; Picardi, Ernesto; Castrignanò, Tiziana
ASPic-GeneID: a lightweight pipeline for gene prediction and alternative isoforms detection.
2013 Alioto, Tyler; Picardi, Ernesto; Guigó, Roderic; Pesole, Graziano
SpliceAid-F: a database of human splicing factors and their RNA-binding sites
2013 Matteo Giulietti; Francesco Piva; Mattia D'Antonio; Paolo D'Onorio De Meo;Daniele Paoletti; Tiziana Castrignano ; Anna Maria D'Erchia; Ernesto Picardi;Federico Zambelli; Giovanni Principato; Giulio Pavesi;Graziano Pesole;;
WEP: a high-performance analysis pipeline for whole-exome data
2013 D'Antonio, Mattia; D'Onorio De Meo, Paolo; Paoletti, Daniele; Elmi, Berardino; Pallocca, Matteo; Sanna, Nico; Picardi, Ernesto; Pesole, Graziano; Castrignanò, Tiziana
| Titolo | Data di pubblicazione | Autore(i) | File |
|---|---|---|---|
| Comparison of ovarian mRNA expression levels in wild and hatchery-produced greater amberjack Seriola dumerili | 1-gen-2024 | Lavecchia, Anna; De Virgilio, Caterina; Mansi, Luigi; Manzari, Caterina; Mylonas, Constantinos C; Picardi, Ernesto; Pousis, Chrysovalentinos; Cox, Sharon N; Ventriglia, Gianluca; Zupa, Rosa; Pesole, Graziano; Corriero, Aldo | |
| Detection of ribonucleotides embedded in DNA by Nanopore sequencing | 1-gen-2024 | Grasso, L.; Fonzino, A.; Manzari, C.; Leonardi, T.; Picardi, E.; Gissi, C.; Lazzaro, F.; Pesole, G.; Muzi-Falconi, M. | |
| Identification of deregulated lncRNAs in Alzheimer’s disease: an integrated gene co-expression network analysis of hippocampus and fusiform gyrus RNA-seq datasets | 1-gen-2024 | Filomena, Ermes; Picardi, Ernesto; Tullo, Apollonia; Pesole, Graziano; D'Erchia, Anna Maria | |
| Macroalgal microbiomes unveil a valuable genetic resource for halogen metabolism | 1-gen-2024 | Lavecchia, Anna; Fosso, Bruno; Engelen, Aschwin H.; Borin, Sara; Manzari, Caterina; Picardi, Ernesto; Pesole, Graziano; Placido, Antonio | |
| Mitochondrial and Nuclear DNA Variants in Amyotrophic Lateral Sclerosis: Enrichment in the Mitochondrial Control Region and Sirtuin Pathway Genes in Spinal Cord Tissue | 1-gen-2024 | NATASHA COX, Sharon; LO GIUDICE, Claudio; Lavecchia, Anna; Luana Poeta, Maria; Chiara, Matteo; Picardi, Ernesto; Pesole, Graziano | |
| OPA1 mutation affects autophagy and triggers senescence in autosomal dominant optic atrophy plus fibroblasts | 1-gen-2024 | Zanfardino, P.; Amati, A.; Doccini, S.; Cox, S. N.; Tullo, A.; Longo, G.; D'Erchia, A.; Picardi, E.; Nesti, C.; Santorelli, F. M.; Petruzzella, V. | |
| Cyclic AMP induces reversible EPAC1 condensates that regulate histone transcription | 1-gen-2023 | Felicia Iannucci, Liliana; D'Erchia, ANNA MARIA; Picardi, Ernesto; Bettio, Daniela; Conca, Filippo; Surdo, NICOLETTA CONCETTA; DI BENEDETTO, Giulietta; Musso, Deborah; Arrigoni, Cristina; Lolicato, Marco; Vismara, Mauro; Grisan, Francesca; Salviati, Leonardo; Milanesi, Luciano; Pesole, Graziano; Lefkimmiatis, Konstantinos | |
| Dysregulation of testis mRNA expression levels in hatchery-produced vs wild greater amberjack Seriola dumerili | 1-gen-2023 | Lavecchia, Anna; Manzari, Caterina; Pousis, Chrysovalentinos; Mansi, Luigi; Cox, Sharon N.; Mylonas, Constantinos C.; Zupa, Rosa; Lo Giudice, Claudio; De Virgilio, Caterina; Picardi, Ernesto; Ventriglia, Gianluca; Pesole, Graziano; Corriero, Aldo | |
| Mitofusin 2 mutation drives cell proliferation in Charcot-Marie-Tooth 2A fibroblasts | 1-gen-2023 | Zanfardino, P.; Longo, G.; Amati, A.; Morani, F.; Picardi, E.; Girolamo, F.; Pafundi, M.; Cox, S. N.; Manzari, C.; Tullo, A.; Doccini, S.; Santorelli, F. M.; Petruzzella, V. | |
| UTRdb 2.0: a comprehensive, expert curated catalog of eukaryotic mRNAs untranslated regions | 1-gen-2023 | Giudice, C. L.; Zambelli, F.; Chiara, M.; Pavesi, G.; Tangaro, M. A.; Picardi, E.; Pesole, G. | |
| "Good Wine Makes Good Blood": An Integrated Approach to Characterize Autochthonous Apulian Grapevines as Promising Candidates for Healthy Wines | 1-gen-2022 | Sabetta, Wilma; Centrone, Mariangela; D'Agostino, Mariagrazia; Difonzo, Graziana; Mansi, Luigi; Tricarico, Giovanni; Venerito, Pasquale; Picardi, Ernesto; Ceci, LUIGI RUGGIERO; Tamma, Grazia; Caponio, Francesco; Montemurro, Cinzia; Volpicella, Mariateresa | |
| Next generation sequencing of SARS-CoV-2 genomes: Challenges, applications and opportunities | 1-gen-2021 | Chiara, M.; D'Erchia, A. M.; Gissi, C.; Manzari, C.; Parisi, A.; Resta, N.; Zambelli, F.; Picardi, E.; Pavesi, G.; Horner, D. S.; Pesole, G. | |
| REDIportal: Millions of novel A-to-I RNA editing events from thousands of RNAseq experiments | 1-gen-2021 | Mansi, L.; Tangaro, M. A.; Lo Giudice, C.; Flati, T.; Kopel, E.; Schaffer, A. A.; Castrignano, T.; Chillemi, G.; Pesole, G.; Picardi, E. | |
| HPC-REDItools: a novel HPC-aware tool for improved large scale RNA-editing analysis | 1-gen-2020 | Flati, Tiziano; Gioiosa, Silvia; Spallanzani, Nicola; Tagliaferri, Ilario; Diroma, Maria Angela; Pesole, Graziano; Chillemi, Giovanni; Picardi, Ernesto; Castrignanò, Tiziana | |
| ASPic-GeneID: a lightweight pipeline for gene prediction and alternative isoforms detection. | 1-gen-2013 | Alioto, Tyler; Picardi, Ernesto; Guigó, Roderic; Pesole, Graziano | |
| SpliceAid-F: a database of human splicing factors and their RNA-binding sites | 1-gen-2013 | Matteo Giulietti; Francesco Piva; Mattia D'Antonio; Paolo D'Onorio De Meo;Daniele Paoletti; Tiziana Castrignano ; Anna Maria D'Erchia; Ernesto Picardi;Federico Zambelli; Giovanni Principato; Giulio Pavesi;Graziano Pesole;; | |
| WEP: a high-performance analysis pipeline for whole-exome data | 1-gen-2013 | D'Antonio, Mattia; D'Onorio De Meo, Paolo; Paoletti, Daniele; Elmi, Berardino; Pallocca, Matteo; Sanna, Nico; Picardi, Ernesto; Pesole, Graziano; Castrignanò, Tiziana |