A RAPD analysis was carried out on 21 artichoke accessions (Cynara cardunculus L. var. scolymus (L.) Fiori) obtained from the world germplasm collection held at the Germplasm Institute in Bari. Fifty decamer primers were used, of which 35 were screened on all accessions. A total of 218 bands were obtained. 25% of which were polymorphic. In order to evaluate genetic similarity, Jaccard index was calculated; its values were comprised between 0.852 and 0.995. Notwithstanding the high morphological diversity, a low genetic variation was detected in artichoke, even though, all the accessions could be distinguished based on RAPD analysis. A certain correspondence between these genetic data and morpho-productive observations was detected.

Un'analisi RAPD è stata condotta su 21 accessioni di carciofo (Cynara cardunculus L. var. scolymus (L.) Fiori) ottenute dalla collezione mondiale disponibile presso l'Istituto del Germoplasma di Bari. In totale sono stati utilizzati 50 oligonucleotidi decamerici di cui 35 sono stati selezionati per lo screening su tutti i campioni. Su un totale di 218 bande di DNA ottenute il 25% ha mostrato un polimorfismo. Per stimare la similarità genetica tra le varie accessioni analizzate è stato calcolato l'indice di Jaccard che oscilla tra un valore minimo di 0.852 ed un massimo di 0.995. Questa analisi suggerisce che vi è una bassa variabilità genetica nonostante la notevole diversità morfologica.

Valutazione della variabilità genetica in germoplasma di carciofo con marcatori RAPD

G Sonnante;A De Paolis;P Perrino
1999

Abstract

A RAPD analysis was carried out on 21 artichoke accessions (Cynara cardunculus L. var. scolymus (L.) Fiori) obtained from the world germplasm collection held at the Germplasm Institute in Bari. Fifty decamer primers were used, of which 35 were screened on all accessions. A total of 218 bands were obtained. 25% of which were polymorphic. In order to evaluate genetic similarity, Jaccard index was calculated; its values were comprised between 0.852 and 0.995. Notwithstanding the high morphological diversity, a low genetic variation was detected in artichoke, even though, all the accessions could be distinguished based on RAPD analysis. A certain correspondence between these genetic data and morpho-productive observations was detected.
1999
Istituto di Bioscienze e Biorisorse
Un'analisi RAPD è stata condotta su 21 accessioni di carciofo (Cynara cardunculus L. var. scolymus (L.) Fiori) ottenute dalla collezione mondiale disponibile presso l'Istituto del Germoplasma di Bari. In totale sono stati utilizzati 50 oligonucleotidi decamerici di cui 35 sono stati selezionati per lo screening su tutti i campioni. Su un totale di 218 bande di DNA ottenute il 25% ha mostrato un polimorfismo. Per stimare la similarità genetica tra le varie accessioni analizzate è stato calcolato l'indice di Jaccard che oscilla tra un valore minimo di 0.852 ed un massimo di 0.995. Questa analisi suggerisce che vi è una bassa variabilità genetica nonostante la notevole diversità morfologica.
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.14243/14425
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