QTL detection for rice grain quality traits using an interspecific backcross population derived from cultivated Asian (O. sativa L.) and African (O. glaberrima S.) rice.

Une population backcross interspécifique avancée issue du croisement entre l'Oryza sativa 'V20A' (une lignée androstérile populaire pour la production de riz hybrides en Chine) et l'Oryza glaberrima (accession IRGC#103544 du Mali) a été employée pour identifier des QTL associés à la qualité et à la morphologie des grains. Au total, 308 familles hybrides BC3F1 ont été évaluées pour 16 caractères liés au grain en conditions de champ à Changsha (Chine) alors que les mêmes lignées ont été analysées pour la ségrégation de marqueurs RFLP et SSR à l'Université Cornell. Onze QTL associés à sept caractères ont été décelés dans six régions chromosomiques, l'allèle favorable provenant de l'O. glaberrima pour huit locus. Des allèles favorables provenant de l'O. glaberrima étaient associés à des améliorations de la forme et de l'apparence des grains. Ces allèles procuraient des grains plus longs, une variation transgressive pour des grains plus minces et une amélioration du ratio longueur/épaisseur. Les allèles de l'O. glaberrima aux autres locus étaient associés à des améliorations potentielles en matière de contenu protéique brut et de rendement en riz brun. Ces résultats suggèrent que les gènes provenant de l'O. glaberrima pourraient s'avérer utiles pour améliorer des caractères spécifiques de la qualité des grains chez des cultivars hybrides à haut rendement de l'O. sativa

An interspecific advanced backcross population derived from a cross between Oryza sativa 'V20A' (a popular male-sterile line used in Chinese rice hybrids) and Oryza glaberrima (accession IRGC No. 103544 from Mali) was used to identify quantitative trait loci (QTL) associated with grain quality and grain morphology. A total of 308 BC3F1 hybrid families were evaluated for 16 grain-related traits under field conditions in Changsha, China, and the same families were evaluated for RFLP and SSR marker segregation at Cornell University (Ithaca, N.Y.). Eleven QTL associated with seven traits were detected in six chromosomal regions, with the favorable allele coming from O. glaberrima at eight loci. Favorable O. glaberrima alleles were associated with improvements in grain shape and appearance, resulting in an increase in kernel length, transgressive variation for thinner grains, and increased length to width ratio. Oryza glaberrima alleles at other loci were associated with potential improvements in crude protein content and brown rice yield. These results suggested that genes from O. glaberrima may be useful in improving specific grain quality characteristics in high-yielding O. sativa hybrid cultivars.