Prunus cerasus var. austera (P. cerasus var. austera) è una specie allotetraploide (AAFF, 2n=4x=32) derivata probabilmente dall'ibridazione tra P. avium and P. fruticosa. In Italia questa specie è coltivata in piccoli appezzamenti o come singole piante di cui spesso non è conosciuta l'origine genetica. L'obiettivo di questo lavoro è di caratterizzare geneticamente il germoplasma di P. cerasus var. austera presente nella regione Umbria in modo da fornire informazioni utili per attuare programmi di conservazione e gestione delle risorse genetiche. Per questo scopo 14 marcatori microsatellitari, sviluppati in Prunus L.sp., sono stati utilizzati per genotipizzare 162 piante di visciola. Il DNA genomico è stato isolato da tessuti fogliari utilizzando il Kit DNeasy 96 plant (Qiagen) e la PCR multiplex è stata eseguita utilizzando il kit Type it (Qiagen). I prodotti di PCR sono stati separati con elettroforesi capillare con un sequenziatore ABI 3130. Le analisi statistiche sono state eseguite con i programmi GenAlEx 6.5, STRUCTURE 2.3.4 e ATetra specifico per le specie tetraploidi. I marcatori microsatellitari ci hanno permesso di caratterizzare geneticamente la varietà austera di P. cerasus, distinguerla dalla varietà caproniana presente sullo stesso territorio e morfologicamente simile. Sono stati inoltre individuati campioni erroneamente identificati come varietà austera. Il germoplasma raccolto è stato raggruppato in 76 genotipi, 52 dei quali rappresentati da un unico individuo mentre i restanti 24 genotipi includono da 2 a 29 individui (cloni). La presenza di cloni può essere spiegata sia con la capacità di propagazione vegetativa della specie che come conseguenza dello scambio di materiale da parte di agricoltori. In conclusione i microsatelliti utilizzati in questo studio si sono dimostrati un ottimo strumento per stimare la diversità genetica della varietà austera di P. cerasus nella regione Umbria, questi risultati sono un promettente punto di partenza per futuri programmi di gestione e conservazione della ricchezza genetica della specie .
CARATTERIZZAZIONE GENETICA DI POPOLAMENTI DI PRUNUS CERASUS VAR. AUSTERA (VISCIOLA) IN UMBRIA
Muriel Gaudet;Claudia Mattioni;Marcello Cherubini;Francesca Chiocchini;Fiorella Villani
2016
Abstract
Prunus cerasus var. austera (P. cerasus var. austera) è una specie allotetraploide (AAFF, 2n=4x=32) derivata probabilmente dall'ibridazione tra P. avium and P. fruticosa. In Italia questa specie è coltivata in piccoli appezzamenti o come singole piante di cui spesso non è conosciuta l'origine genetica. L'obiettivo di questo lavoro è di caratterizzare geneticamente il germoplasma di P. cerasus var. austera presente nella regione Umbria in modo da fornire informazioni utili per attuare programmi di conservazione e gestione delle risorse genetiche. Per questo scopo 14 marcatori microsatellitari, sviluppati in Prunus L.sp., sono stati utilizzati per genotipizzare 162 piante di visciola. Il DNA genomico è stato isolato da tessuti fogliari utilizzando il Kit DNeasy 96 plant (Qiagen) e la PCR multiplex è stata eseguita utilizzando il kit Type it (Qiagen). I prodotti di PCR sono stati separati con elettroforesi capillare con un sequenziatore ABI 3130. Le analisi statistiche sono state eseguite con i programmi GenAlEx 6.5, STRUCTURE 2.3.4 e ATetra specifico per le specie tetraploidi. I marcatori microsatellitari ci hanno permesso di caratterizzare geneticamente la varietà austera di P. cerasus, distinguerla dalla varietà caproniana presente sullo stesso territorio e morfologicamente simile. Sono stati inoltre individuati campioni erroneamente identificati come varietà austera. Il germoplasma raccolto è stato raggruppato in 76 genotipi, 52 dei quali rappresentati da un unico individuo mentre i restanti 24 genotipi includono da 2 a 29 individui (cloni). La presenza di cloni può essere spiegata sia con la capacità di propagazione vegetativa della specie che come conseguenza dello scambio di materiale da parte di agricoltori. In conclusione i microsatelliti utilizzati in questo studio si sono dimostrati un ottimo strumento per stimare la diversità genetica della varietà austera di P. cerasus nella regione Umbria, questi risultati sono un promettente punto di partenza per futuri programmi di gestione e conservazione della ricchezza genetica della specie .I documenti in IRIS sono protetti da copyright e tutti i diritti sono riservati, salvo diversa indicazione.
