An introduction to next generation sequencing for studying omic-environment interactions.

questa presentazione rivisiteremo il concetto di interazione geneambiente alla luce delle conoscenze scientifiche emergenti e dell'utilizzo delle tecnologie ad alta risoluzione, quali i moderni sequenziatori. In particolare, illustreremo l'importanza della stima di tale interazione per la comprensione delle patologie complesse. Quindi, forniremo una panoramica dei metodi esistenti per l'analisi di dati di NGS con particolare enfasi riguardo l'individuazione di varianti genomiche ed l'analisi dell'epigenomica e della trascrittomica. Infine, discuteremo come i dati multiomici possono essere utilizzati per migliorare in nostro grado di comprensione delle patologie e fornire nuove prospettive di ricerca

In this talk, first, we review the concept of gene-environmental interaction on the light of emerging results and the use of modern high-throughput technologies; we illustrate its impact on the understanding of complex human diseases. Then, we provide an overview of the methods available to process NGS data with particular emphasis to the detection of genomic variants, the analysis of epigenomic and transcriptional data produced by modern sequencers. Finally, we discuss how multiomic data can be used to improve our way of studying complex diseases and can provide novel research perspectives.