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The electrocardiographic PR interval (or PQ interval) reflects atrial and atrioventricular nodal conduction, disturbances of which increase risk of atrial fibrillation. We report a meta-analysis of genome-wide association studies for PR interval from seven population-based European studies in the CHARGE Consortium: AGES, ARIC, CHS, FHS, KORA, Rotterdam Study, and SardiNIA (N = 28,517). We identified nine loci associated with PR interval at P < 5 x10-8. At the 3p22.2 locus, we observed two independent associations in voltage-gated sodium channel genes, SCN10A and SCN5A. Six of the loci were near cardiac developmental genes, including CAV1-CAV2, NKX2-5 (CSX1), SOX5, WNT11, MEIS1, and TBX5-TBX3, providing pathophysiologically interesting candidate genes. Five of the loci, SCN5A, SCN10A, NKX2-5, CAV1-CAV2, and SOX5, were also associated with atrial fibrillation (N= 5,741 cases, P < 0.0056). This suggests a role for common variation in ion channel and developmental genes in atrial and atrioventricular conduction as well as in susceptibility to atrial fibrillation.
Genomewide association study of PR interval
Arne Pfeufer;Charlotte van Noord;Kristin D Marciante;Dan E Arking;Martin G Larson;Albert Vernon Smith;Kirill V Tarasov;Martina Müller;Nona Sotoodehnia;Moritz F Sinner;Germaine C Verwoert;Man Li;W H Linda Kao;Anna Köttgen;Josef Coresh;Joshua C Bis;Bruce M Psaty;Kenneth Rice;Jerome I Rotter;Fernando Rivadeneira;Albert Hofman;Jan A Kors;Bruno H C Stricker;André G Uitterlinden;Cornelia M van Duijn;Britt M Beckmann;Wiebke Sauter;Christian Gieger;Steven A Lubitz;Christopher NewtonCheh;Thomas J Wang;Jared W Magnani;Renate B Schnabel;Mina K Chung;John Barnard;Jonathan D Smith;David R Van Wagoner;Ramachandran S Vasan;Thor Aspelund;Gudny Eiriksdottir;Tamara B Harris;Lenore J Launer;Samer S Najjar;Edward Lakatta;David Schlessinger;Manuela Uda;Gonçalo R Abecasis;Bertram MüllerMyhsok;Georg B Ehret;Eric Boerwinkle;Aravinda Chakravarti;Elsayed Z Soliman;Kathryn L Lunetta;Siegfried Perz;HErich Wichmann;Thomas Meitinger;Daniel Levy;Vilmundur Gudnason;Patrick T Ellinor;Serena Sanna;Stefan Kääb;Jacqueline C M Witteman;Alvaro Alonso;Emelia J Benjamin;Susan R Heckbert
2010
Abstract
The electrocardiographic PR interval (or PQ interval) reflects atrial and atrioventricular nodal conduction, disturbances of which increase risk of atrial fibrillation. We report a meta-analysis of genome-wide association studies for PR interval from seven population-based European studies in the CHARGE Consortium: AGES, ARIC, CHS, FHS, KORA, Rotterdam Study, and SardiNIA (N = 28,517). We identified nine loci associated with PR interval at P < 5 x10-8. At the 3p22.2 locus, we observed two independent associations in voltage-gated sodium channel genes, SCN10A and SCN5A. Six of the loci were near cardiac developmental genes, including CAV1-CAV2, NKX2-5 (CSX1), SOX5, WNT11, MEIS1, and TBX5-TBX3, providing pathophysiologically interesting candidate genes. Five of the loci, SCN5A, SCN10A, NKX2-5, CAV1-CAV2, and SOX5, were also associated with atrial fibrillation (N= 5,741 cases, P < 0.0056). This suggests a role for common variation in ion channel and developmental genes in atrial and atrioventricular conduction as well as in susceptibility to atrial fibrillation.
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall'Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l'Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
