FOSSO, BRUNO
FOSSO, BRUNO
Istituto di Biomembrane, Bioenergetica e Biotecnologie Molecolari (IBIOM)
Macroalgal microbiomes unveil a valuable genetic resource for halogen metabolism
2024 Lavecchia, Anna; Fosso, Bruno; Engelen, Aschwin H.; Borin, Sara; Manzari, Caterina; Picardi, Ernesto; Pesole, Graziano; Placido, Antonio
Amplicon-Based Microbiome Profiling: From Second- to Third-Generation Sequencing for Higher Taxonomic Resolution
2023 Notario, Elisabetta; Visci, Grazia; Fosso, Bruno; Gissi, Carmela; Tanaskovic, Nina; Rescigno, Maria; Marzano, Marinella; Pesole, Graziano
Hippocampus guttulatus diet based on DNA metabarcoding
2023 Tamara, Lazic; Fosso, Bruno; Balech, Bachir; Giuseppe, Corriero; Gristina, Michele; Marzano, Marinella; Pesole, Graziano; Santamaria, Monica; Pierri, Cataldo
Shelf-life extension of leavened bakery products by using bio-protective cultures and type-III sourdough
2023 Calasso, Maria; Marzano, Marinella; Caponio, Giusy Rita; Celano, Giuseppe; Fosso, Bruno; Calabrese, Francesco Maria; De Palma, Domenico; Vacca, Mirco; Notario, Elisabetta; Pesole, Graziano; De Angelis, Maria; De Leo, Francesca
Complement downregulation promotes an inflammatory signature that renders colorectal cancer susceptible to immunotherapy
2022 Krieg, Carsten; Weber, Lukas M; Fosso, Bruno; Marzano, Marinella; Hardiman, Gary; Olcina, Monica M; Domingo, Enric; El Aidy, Sahar; Mallah, Khalil; Robinson, Mark D; Guglietta, Silvia
Extension of the shelf-life of fresh pasta using modified atmosphere packaging and bioprotective cultures
2022 Marzano, Marinella; Calasso, Maria; Caponio, Giusy Rita; Celano, Giuseppe; Fosso, Bruno; De Palma, Domenico; Vacca, Mirco; Notario, Elisabetta; Pesole, Graziano; De Leo, Francesca; De Angelis, Maria
Farnesoid X receptor activation by the novel agonist TC-100 (3α, 7α, 11β-Trihydroxy-6α-ethyl-5β-cholan-24-oic Acid) preserves the intestinal barrier integrity and promotes intestinal microbial reshaping in a mouse model of obstructed bile acid flow
2022 Marzano, M.; Fosso, Bruno; Colliva, C.; Notario, E.; Passeri, D.; Intranuovo, M.; Gioiello, A.; Adorini, L.; Pesole, G.; Pellicciari, R.; Moschetta, A.; Gadaleta, R. M.
Microbiome composition indicate dysbiosis and lower richness in tumor breast tissues compared to healthy adjacent paired tissue, within the same women
2022 Esposito; Maria Valeria;Fosso; Bruno;Nunziato; Marcella;Casaburi; Giorgio;D'Argenio; Valeria;Calabrese; Alessandra;D'Aiuto; Massimiliano;Botti; Gerardo;Pesole; Graziano;Salvatore; Francesco
Morphological, molecular, and biochemical study of cyanobacteria from a eutrophic Algerian reservoir (Cheffia)
2022 Benredjem; Lamia;Berredjem; Hajira;Abdi; Akila;Casero; Maria Cristina;Quesada; Antonio;Fosso; Bruno;Marzano; Marinella;Pesole; Graziano;Azevedo; Joana;Vasconcelos; Vitor
Natural and after colon washing fecal samples: the two sides of the coin for investigating the human gut microbiome
2022 Piancone, Elisabetta; Fosso, Bruno; Marzano, Marinella; De Robertis, Mariangela; Notario, Elisabetta; Oranger, Annarita; Manzari, Caterina; Bruno, Silvia; Visci, Grazia; Defazio, Giuseppe; D'Erchia, Anna Maria; Filomena, Ermes; Maio, Dominga; Minelli, Martina; Vergallo, Ilaria; Minelli, Mauro; Pesole, Graziano
A primer on machine learning techniques for genomic applications
2021 Monaco, Alfonso; Pantaleo, Ester; Amoroso, Nicola; Lacalamita, Antonio; Lo Giudice, Claudio; Fonzino, Adriano; Fosso, Bruno; Picardi, Ernesto; Tangaro, Sabina; Pesole, Graziano; Bellotti, Roberto
Accurate detection and quantification of SARS-CoV-2 genomic and subgenomic mRNAs by ddPCR and meta-transcriptomics analysis
2021 Oranger, Annarita; Manzari, Caterina; Chiara, Matteo; Notario, Elisabetta; Fosso, Bruno; Parisi, Antonio; Bianco, Angelica; Iacobellis, Michela; D'Avenia, Morena; D'Erchia, Anna Maria; Pesole, Graziano
Evaluating the Efficiency of DNA Metabarcoding to Analyze the Diet of Hippocampus guttulatus (Teleostea: Syngnathidae)
2021 Lazic, Tamara; Pierri, Cataldo; Corriero, Giuseppe; Balech, Bachir; Cardone, Frine; Deflorio, Michele; Fosso, Bruno; Gissi, Carmela; Marzano, Marinella; Nonnis Marzano, Francesco; Pesole, Graziano; Santamaria, Monica; Gristina, Michele
ITSoneWB: profiling global taxonomic diversity of eukaryotic communities on Galaxy
2021 A Tangaro, Marco; Defazio, Giuseppe; Fosso, Bruno; Licciulli, VITO FLAVIO; Grillo, Giorgio; Donvito, Giacinto; Lavezzo, Enrico; Baruzzo, Giacomo; Pesole, Graziano; Santamaria, Monica
Microbiome as Mediator of Diet on Colorectal Cancer Risk: The Role of Vitamin D, Markers of Inflammation and Adipokines
2021 Serrano, Davide; Pozzi, Chiara; Guglietta, Silvia; Fosso, Bruno; Suppa, Mariano; Gnagnarella, Patrizia; Corso, Federica; Bellerba, Federica; Macis, Debora; Aristarco, Valentina; Manghi, Paolo; Segata, Nicola; Trovato, Cristina; Zampino Maria, Giulia; Marzano, Marinella; Bonanni, Bernardo; Rescigno, Maria; Gandini, Sara
Stem cell impairment at the host-microbiota interface in colorectal cancer
2021 Marzano, M; Fosso, B; Piancone, E; Defazio, G; Pesole, G; De Robertis, M
A Differential Metabarcoding Approach to Describe Taxonomy Profiles of Bacteria and Archaea in the Saltern of Margherita di Savoia (Italy)
2020 Leoni, Claudia; Volpicella, Mariateresa; Fosso, Bruno; Manzari, Caterina; Piancone, Elisabetta; G Dileo, Maria C; Arcadi, Erika; Yakimov, Michail; Pesole, Graziano; R Ceci, Luigi
Accurate quantification of bacterial abundance in metagenomic DNAs accounting for variable DNA integrity levels
2020 Manzari, Caterina; Oranger, Annarita; Fosso, Bruno; Piancone, Elisabetta; Pesole, Graziano; D'Erchia, ANNA MARIA
Complement C3aR loss drives colorectal cancer by modulating gut microbiota
2020 Guglietta, Silvia; Carloni, Sara; Darwich, Abbass; Fosso, Bruno; M Weber, Lukas; D Robinson, Mark; Pesole, Graziano; Rescigno, Maria; Krieg, Carsten
Endogenous murine microbiota member Faecalibaculum rodentium and its human homologue protect from intestinal tumour growth
2020 Elena Zagato ;; Chiara Pozzi ; Alice Bertocchi; Tiziana Schioppa; Fabiana Saccheri;Silvia Guglietta ; Bruno Fosso ; Laura Melocchi; Giulia Nizzoli; Jacopo Troisi ;;Marinella Marzano; Bianca Oresta; Ilaria Spadoni; Koji Atarashi ; Sara Carloni ;Stefania Arioli ; Giulia Fornasa; Francesco Asnicar ; Nicola Segata ; Simone Guglielmetti ; Kenya Honda ; Graziano Pesole ; William Vermi; Giuseppe Penna;Maria Rescigno ;
| Titolo | Data di pubblicazione | Autore(i) | File |
|---|---|---|---|
| Macroalgal microbiomes unveil a valuable genetic resource for halogen metabolism | 1-gen-2024 | Lavecchia, Anna; Fosso, Bruno; Engelen, Aschwin H.; Borin, Sara; Manzari, Caterina; Picardi, Ernesto; Pesole, Graziano; Placido, Antonio | |
| Amplicon-Based Microbiome Profiling: From Second- to Third-Generation Sequencing for Higher Taxonomic Resolution | 1-gen-2023 | Notario, Elisabetta; Visci, Grazia; Fosso, Bruno; Gissi, Carmela; Tanaskovic, Nina; Rescigno, Maria; Marzano, Marinella; Pesole, Graziano | |
| Hippocampus guttulatus diet based on DNA metabarcoding | 1-gen-2023 | Tamara, Lazic; Fosso, Bruno; Balech, Bachir; Giuseppe, Corriero; Gristina, Michele; Marzano, Marinella; Pesole, Graziano; Santamaria, Monica; Pierri, Cataldo | |
| Shelf-life extension of leavened bakery products by using bio-protective cultures and type-III sourdough | 1-gen-2023 | Calasso, Maria; Marzano, Marinella; Caponio, Giusy Rita; Celano, Giuseppe; Fosso, Bruno; Calabrese, Francesco Maria; De Palma, Domenico; Vacca, Mirco; Notario, Elisabetta; Pesole, Graziano; De Angelis, Maria; De Leo, Francesca | |
| Complement downregulation promotes an inflammatory signature that renders colorectal cancer susceptible to immunotherapy | 1-gen-2022 | Krieg, Carsten; Weber, Lukas M; Fosso, Bruno; Marzano, Marinella; Hardiman, Gary; Olcina, Monica M; Domingo, Enric; El Aidy, Sahar; Mallah, Khalil; Robinson, Mark D; Guglietta, Silvia | |
| Extension of the shelf-life of fresh pasta using modified atmosphere packaging and bioprotective cultures | 1-gen-2022 | Marzano, Marinella; Calasso, Maria; Caponio, Giusy Rita; Celano, Giuseppe; Fosso, Bruno; De Palma, Domenico; Vacca, Mirco; Notario, Elisabetta; Pesole, Graziano; De Leo, Francesca; De Angelis, Maria | |
| Farnesoid X receptor activation by the novel agonist TC-100 (3α, 7α, 11β-Trihydroxy-6α-ethyl-5β-cholan-24-oic Acid) preserves the intestinal barrier integrity and promotes intestinal microbial reshaping in a mouse model of obstructed bile acid flow | 1-gen-2022 | Marzano, M.; Fosso, Bruno; Colliva, C.; Notario, E.; Passeri, D.; Intranuovo, M.; Gioiello, A.; Adorini, L.; Pesole, G.; Pellicciari, R.; Moschetta, A.; Gadaleta, R. M. | |
| Microbiome composition indicate dysbiosis and lower richness in tumor breast tissues compared to healthy adjacent paired tissue, within the same women | 1-gen-2022 | Esposito; Maria Valeria;Fosso; Bruno;Nunziato; Marcella;Casaburi; Giorgio;D'Argenio; Valeria;Calabrese; Alessandra;D'Aiuto; Massimiliano;Botti; Gerardo;Pesole; Graziano;Salvatore; Francesco | |
| Morphological, molecular, and biochemical study of cyanobacteria from a eutrophic Algerian reservoir (Cheffia) | 1-gen-2022 | Benredjem; Lamia;Berredjem; Hajira;Abdi; Akila;Casero; Maria Cristina;Quesada; Antonio;Fosso; Bruno;Marzano; Marinella;Pesole; Graziano;Azevedo; Joana;Vasconcelos; Vitor | |
| Natural and after colon washing fecal samples: the two sides of the coin for investigating the human gut microbiome | 1-gen-2022 | Piancone, Elisabetta; Fosso, Bruno; Marzano, Marinella; De Robertis, Mariangela; Notario, Elisabetta; Oranger, Annarita; Manzari, Caterina; Bruno, Silvia; Visci, Grazia; Defazio, Giuseppe; D'Erchia, Anna Maria; Filomena, Ermes; Maio, Dominga; Minelli, Martina; Vergallo, Ilaria; Minelli, Mauro; Pesole, Graziano | |
| A primer on machine learning techniques for genomic applications | 1-gen-2021 | Monaco, Alfonso; Pantaleo, Ester; Amoroso, Nicola; Lacalamita, Antonio; Lo Giudice, Claudio; Fonzino, Adriano; Fosso, Bruno; Picardi, Ernesto; Tangaro, Sabina; Pesole, Graziano; Bellotti, Roberto | |
| Accurate detection and quantification of SARS-CoV-2 genomic and subgenomic mRNAs by ddPCR and meta-transcriptomics analysis | 1-gen-2021 | Oranger, Annarita; Manzari, Caterina; Chiara, Matteo; Notario, Elisabetta; Fosso, Bruno; Parisi, Antonio; Bianco, Angelica; Iacobellis, Michela; D'Avenia, Morena; D'Erchia, Anna Maria; Pesole, Graziano | |
| Evaluating the Efficiency of DNA Metabarcoding to Analyze the Diet of Hippocampus guttulatus (Teleostea: Syngnathidae) | 1-gen-2021 | Lazic, Tamara; Pierri, Cataldo; Corriero, Giuseppe; Balech, Bachir; Cardone, Frine; Deflorio, Michele; Fosso, Bruno; Gissi, Carmela; Marzano, Marinella; Nonnis Marzano, Francesco; Pesole, Graziano; Santamaria, Monica; Gristina, Michele | |
| ITSoneWB: profiling global taxonomic diversity of eukaryotic communities on Galaxy | 1-gen-2021 | A Tangaro, Marco; Defazio, Giuseppe; Fosso, Bruno; Licciulli, VITO FLAVIO; Grillo, Giorgio; Donvito, Giacinto; Lavezzo, Enrico; Baruzzo, Giacomo; Pesole, Graziano; Santamaria, Monica | |
| Microbiome as Mediator of Diet on Colorectal Cancer Risk: The Role of Vitamin D, Markers of Inflammation and Adipokines | 1-gen-2021 | Serrano, Davide; Pozzi, Chiara; Guglietta, Silvia; Fosso, Bruno; Suppa, Mariano; Gnagnarella, Patrizia; Corso, Federica; Bellerba, Federica; Macis, Debora; Aristarco, Valentina; Manghi, Paolo; Segata, Nicola; Trovato, Cristina; Zampino Maria, Giulia; Marzano, Marinella; Bonanni, Bernardo; Rescigno, Maria; Gandini, Sara | |
| Stem cell impairment at the host-microbiota interface in colorectal cancer | 1-gen-2021 | Marzano, M; Fosso, B; Piancone, E; Defazio, G; Pesole, G; De Robertis, M | |
| A Differential Metabarcoding Approach to Describe Taxonomy Profiles of Bacteria and Archaea in the Saltern of Margherita di Savoia (Italy) | 1-gen-2020 | Leoni, Claudia; Volpicella, Mariateresa; Fosso, Bruno; Manzari, Caterina; Piancone, Elisabetta; G Dileo, Maria C; Arcadi, Erika; Yakimov, Michail; Pesole, Graziano; R Ceci, Luigi | |
| Accurate quantification of bacterial abundance in metagenomic DNAs accounting for variable DNA integrity levels | 1-gen-2020 | Manzari, Caterina; Oranger, Annarita; Fosso, Bruno; Piancone, Elisabetta; Pesole, Graziano; D'Erchia, ANNA MARIA | |
| Complement C3aR loss drives colorectal cancer by modulating gut microbiota | 1-gen-2020 | Guglietta, Silvia; Carloni, Sara; Darwich, Abbass; Fosso, Bruno; M Weber, Lukas; D Robinson, Mark; Pesole, Graziano; Rescigno, Maria; Krieg, Carsten | |
| Endogenous murine microbiota member Faecalibaculum rodentium and its human homologue protect from intestinal tumour growth | 1-gen-2020 | Elena Zagato ;; Chiara Pozzi ; Alice Bertocchi; Tiziana Schioppa; Fabiana Saccheri;Silvia Guglietta ; Bruno Fosso ; Laura Melocchi; Giulia Nizzoli; Jacopo Troisi ;;Marinella Marzano; Bianca Oresta; Ilaria Spadoni; Koji Atarashi ; Sara Carloni ;Stefania Arioli ; Giulia Fornasa; Francesco Asnicar ; Nicola Segata ; Simone Guglielmetti ; Kenya Honda ; Graziano Pesole ; William Vermi; Giuseppe Penna;Maria Rescigno ; |